短信没有了但仍然显示有消息提醒可能有以下几种原因。
1、网络延迟或系统卡顿：由于网络或系统的问题，短信已经被读取或删除，但通知仍然没有及时更新，可以尝试重启手机或等待一段时间，看通知是否消失。
2、短信应用的问题：可能是短信应用本身存在问题，导致消息通知异常，可以尝试进入短信应用设置，查看是否有未读或未处理的消息。
3、系统通知设置问题：可能是手机系统通知设置出现了问题，导致即使短信已经处理完毕，仍然显示有消息提醒，可以检查手机的系统设置，查看通知管理选项，找到短信应用并检查其通知设置。
4、第三方应用干扰：有些第三方应用可能会拦截或干扰短信应用的功能，导致消息提醒异常，可以尝试关闭一些第三方应用，或者卸载最近安装的应用，看是否能解决问题。
如果以上方法都无法解决问题，建议备份重要数据并尝试恢复出厂设置，或者寻求专业技术人员的帮助。
