短信提示扣三分但12123交罚款记0分，可能存在以下两种情况。
1、这种情况很可能是因为交警部门系统记录有误，或者是短信通知出现了延迟，如果已经按照规定处理了违章，并且已经缴纳了罚款，这种情况下不用太担心，有时候系统需要一段时间来更新信息，只要确保已经及时处理了违章并缴纳了罚款，就不会有什么问题，建议等待一段时间，或者联系交警部门查询具体情况。
2、还有一种可能是车主处理的是其他扣分记录，而短信通知的扣分记录可能是其他车辆的扣分记录，车主可以检查自己的车辆是否存在其他扣分情况，或者联系交警部门查询核实，如果确实是误操作或者其他原因导致的错误通知，可以向交警部门提出申诉，他们会进行核实并处理。
如果遇到短信通知与实际处理情况不符的情况，建议及时联系交警部门查询核实，以便了解具体情况并采取相应的措施。
