苹果系统更新后，短信数据是否保留及安全性取决于多个因素。
如果进行的是iOS系统版本的更新，那么短信数据通常会保留，因为系统更新与数据删除并不是直接相关，苹果公司在设计系统时考虑到了用户数据的连续性，所以在大多数情况下，系统更新不会删除用户数据。
如果在系统更新过程中遇到意外情况（如更新失败或设备故障），可能会导致数据丢失，如果用户选择通过iTunes或iCloud备份恢复设备，并且备份不包含最新的短信数据，那么更新后可能无法恢复这些短信。
关于更新后的安全性问题，苹果公司会不断推出系统更新以修复潜在的安全漏洞和隐患，提高系统的安全性，进行系统更新有助于增强设备的安全性，即使系统是最新的，仍然需要用户保持警惕，避免点击不明链接或下载未经验证的软件，以防止恶意软件或网络攻击。
苹果系统更新后短信数据通常会保留，并且系统更新有助于增强设备的安全性，建议用户在更新前备份重要数据以防万一，并保持警惕以避免安全风险，如果仍有关于数据安全的疑虑，建议咨询苹果官方客服或专业技术人员。
