如果拼多多店铺收到起诉短信并需要办理营业执照注销，可以按照以下步骤进行。
1、读取起诉短信内容，明确起诉的原因，如果涉及到营业执照的问题，需要尽快处理。
2、先办理拼多多店铺的注销，联系拼多多客服，提交店铺注销申请，按照平台的要求提供相关的资料和信息。
3、店铺注销后，需要前往当地工商行政管理部门或者市场监督管理局办理营业执照的注销，需要携带营业执照正本和副本、身份证等相关材料。
4、提交材料并说明注销原因，在提交材料时，需要详细说明营业执照的注销原因，例如店铺关闭、业务转型等。
5、办理注销手续，按照当地工商行政管理部门或市场监督管理局的要求，完成注销手续。
6、在完成注销手续后，需要关注是否还有其他未解决的问题，如税务、社保等问题，如果有，需要及时处理。
7、保存好所有相关文件和证明，以备不时之需。
如果收到起诉短信涉及到的法律问题较为复杂，建议咨询专业律师以获取更专业的法律意见和帮助。
仅供参考，具体流程和所需材料可能因各地要求而有所不同，建议咨询当地相关部门或专业服务机构获取详细信息和帮助。
