要查询电话号码被什么软件标记了，可以采取以下几种方法。
1、使用第三方软件查询：例如搜狗号码通等，这些软件可以查询电话号码的标记情况，直接在软件中输入电话号码即可查询。
2、通过运营商的营业厅查询：联系运营商客服，查询电话号码的标记记录，可能需要提供身份证明和电话号码的相关信息。
3、使用在线查询工具：一些在线查询工具可以帮助查询电话号码是否被标记，比如通过搜索引擎查询相关网站或工具。
需要注意的是，为了保护个人隐私和信息安全，查询电话标记时应当确保使用正规渠道和工具，避免泄露个人信息，如果发现电话号码被误标记，可以及时联系相关软件或运营商进行申诉处理。
