如果借呗已经逾期并且已经被上报到人民银行征信系统，即使已经还清，这条逾期记录仍然会被保留在征信系统里。一般情况下，这条记录不会被消除，因为人民银行征信系统的数据是记录个人信用状况的重要参考。
如果认为自己的信用记录存在错误或需要补充说明的情况，可以向人行征信中心提出异议申请，进行信用修复，在这个过程中，可以联系借呗的客服或者银行相关部门了解具体如何操作。
至于打电话消除逾期记录，一般来说是不可能的，因为征信系统的数据是自动更新的，不能通过人工干预的方式删除或修改数据，建议在借贷过程中一定要谨慎，尽量避免逾期等不良影响。
仅供参考，建议咨询借呗官方客服或人民银行客服，获取更准确的信息。
