收到短信通知违章扣三分但并没有提及罚款的情况，可能是因为违章情况并不涉及罚款，或者罚款已由相关部门处理。但为了确保个人权益不受影响，建议采取以下措施。
1、核实短信的真实性：确保收到的短信确实来自官方部门，可以通过查询官方电话进行核实。
2、查询具体违章信息：可以登录当地交警部门的网站或使用相关APP查询具体的违章记录，了解详细的违章情况和处理结果。
3、前往交警部门咨询：如果仍有疑虑，可以携带相关证件前往当地交警部门咨询，了解准确情况。
收到短信通知后应关注并处理违章情况，确保个人权益不受影响，为了遵守交通规则，保障自身和他人的安全，请务必注意驾驶过程中的各项规定。
仅供参考，如有更多疑问，可以咨询专业法律人士以获得更多帮助。
