短信莫名其妙不见了可能有以下几种原因。
1、短信可能被意外删除，有时候在清理手机内存或者删除一些短信时，可能会不小心删除一些重要的短信。
2、手机系统问题，有时候手机系统可能会出现问题，导致短信无法保存或者丢失，可以尝试重启手机或者恢复手机出厂设置，看看是否能解决问题。
3、短信可能被移动到了其他文件夹或者隐藏了起来，在手机中，有一些短信应用支持将短信分类存储到不同的文件夹中，或者提供了隐藏短信的功能，可以检查一下这些功能是否开启，或者是否误操作将短信移动到了其他位置。
4、手机中病毒或者安装了恶意软件，有些病毒会破坏手机中的短信数据，或者恶意软件会拦截、删除短信，可以安装杀毒软件进行扫描和清理。
5、运营商系统故障或网络延迟也可能导致短信无法接收或保存，这种情况需要联系运营商咨询相关情况。
如果确认短信不是误删或自己操作的，而且手机也并未中病毒等，可以尝试联系手机品牌客服寻求帮助，他们可能会给出更具体的解决方案，如果短信非常重要，也可以尝试联系运营商寻求帮助恢复。
