如果您的苹果手机短信已经清空，但仍然显示数字提示未读短信数量，这可能是由于以下几个原因造成的。
1、短信应用缓存或同步问题：即使短信已经被删除，短信应用的缓存或同步过程中可能会出现延迟，导致数字提示仍然显示，您可以尝试重启设备或重新登录您的iCloud账户来解决这个问题。
2、未完全删除短信：在某些情况下，即使您已经删除了短信，它们可能仍然在“已删除”文件夹中保留一段时间，您可以检查并清空“已删除”文件夹来解决问题。
3、通知设置问题：如果您的通知设置不正确，可能会导致短信数字提示不正确，您可以检查并调整通知设置，确保短信应用正确地显示了未读消息数量。
如果您尝试了以上方法仍然无法解决问题，建议您尝试重置所有设置或联系苹果客服寻求帮助，在进行任何操作之前，请确保备份您的设备以防止数据丢失。
