苹果手机短信删除后仍显示有未读信息的原因可能有以下几种可能性。
1、短信可能尚未同步：当设备连接到iCloud或iTunes时，短信的删除和同步可能不同步，在这种情况下，可以尝试手动同步设备以查看是否解决了问题，可以通过设置中点击顶部的名字，然后点击“iCloud”，确保短信开关已经打开并同步，也可以重启设备来尝试解决问题。
2、短信可能被转移到其他位置：可能在删除某些短信时误操作，将其转移到了其他文件夹或其他位置，这时需要检查是否设置了短信文件夹，并查看是否将短信移动到了其他位置。
3、系统错误或软件问题：可能是iOS系统出现错误或短信应用出现问题，可以尝试更新iOS系统到最新版本，或者重新下载短信应用来解决问题，如果问题仍然存在，可能需要联系苹果官方客服或者到苹果专卖店寻求帮助。
4、未读通知可能在通知中心保留：即使短信已经被删除，相关的通知可能仍然保留在通知中心里，可以进入通知中心检查是否有未读通知并尝试清除它们。
如果以上方法都不能解决问题，建议联系苹果的技术支持以获得进一步的帮助。
