如果您在iPhone上收到提示说有未读短信，但打开短信应用后并没有看到未读短信，可能有以下几种原因。
1、短信应用缓存或数据同步问题：尝试关闭短信应用，然后重新打开，看看是否仍然显示未读短信，如果问题仍然存在，可以尝试重新启动设备，这有助于清除应用程序缓存并同步数据。
2、通知错误：系统通知可能会出现错误，导致误报未读短信，请确保您的通知设置正确，并且没有开启任何导致误报通知的功能。
3、短信被删除或移动：可能有人在您收到通知后删除了某些短信，或者您可能不小心将它们移动到了其他文件夹或归档，请检查您的短信文件夹和归档文件夹，看看是否有未读短信被移动或删除。
4、iMessage同步问题：如果您使用的是iMessage信息，并且多个设备使用相同的Apple ID进行同步，那么可能存在同步问题，尝试在iCloud设置中关闭iMessage并重新打开，或者尝试禁用和重新启用信息应用的iCloud同步。
如果以上方法都无法解决问题，建议您尝试恢复系统或联系苹果官方客服寻求帮助。
