如果您的苹果手机短信已经删除了，但仍然显示数字提示未读短信，可能有以下几种原因和解决方法。
1、短信应用中的“通知标记”功能未关闭，即使短信被删除，只要该功能开启，通知中心仍然会显示数字提示未读短信，您可以进入“设置”-“通知”-找到“信息”应用，关闭“通知标记”功能即可。
2、部分短信可能已被转移到其他文件夹或应用程序中，您可以尝试在短信应用中的文件夹或其他相关应用中查找这些短信，如果找到了，长按这些短信并选择删除即可解决问题。
3、系统缓存或错误导致的问题，您可以尝试重启手机，这有助于清除缓存并可能解决数字显示的问题，如果问题仍然存在，您可以尝试备份手机数据并恢复出厂商设置，但请注意，这将删除所有手机数据，请确保备份重要数据。
如果以上方法都无法解决问题，建议您联系苹果官方客服或前往附近的苹果专卖店寻求帮助。
